Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F6O75461 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F6O75461 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F6O75461 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F6O75461 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F6O75461 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F6O75461 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F6O75461 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F6O75461 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F6O75461 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F6O75461 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F6O75461 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F6O75461 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
E2F6O75461 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
E2F6O75461 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
E2F6O75461 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F6O75461 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F6O75461 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F6O75461 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F6O75461 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F6O75461 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F6O75461 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F6O75461 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F6O75461 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F6O75461 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F6O75461 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F6O75461 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms