Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VAMP4O75379 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms