Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF40O75150 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF40O75150 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF40O75150 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF40O75150 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF40O75150 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF40O75150 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF40O75150 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF40O75150 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF40O75150 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF40O75150 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF40O75150 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF40O75150 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF40O75150 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF40O75150 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF40O75150 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF40O75150 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF40O75150 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF40O75150 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF40O75150 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF40O75150 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF40O75150 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF40O75150 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF40O75150 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF40O75150 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF40O75150 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF40O75150 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF40O75150 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF40O75150 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF40O75150 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF40O75150 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF40O75150 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF40O75150 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF40O75150 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF40O75150 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF40O75150 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF40O75150 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF40O75150 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF40O75150 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF40O75150 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF40O75150 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms