Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NBNO60934 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBNO60934 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBNO60934 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBNO60934 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBNO60934 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBNO60934 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBNO60934 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBNO60934 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBNO60934 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBNO60934 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBNO60934 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBNO60934 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBNO60934 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NBNO60934 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NBNO60934 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NBNO60934 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NBNO60934 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NBNO60934 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBNO60934 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBNO60934 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBNO60934 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBNO60934 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NBNO60934 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBNO60934 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBNO60934 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBNO60934 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBNO60934 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBNO60934 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBNO60934 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBNO60934 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBNO60934 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBNO60934 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBNO60934 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBNO60934 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBNO60934 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NBNO60934 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBNO60934 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBNO60934 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBNO60934 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBNO60934 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBNO60934 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBNO60934 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBNO60934 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBNO60934 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBNO60934 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBNO60934 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBNO60934 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBNO60934 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBNO60934 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBNO60934 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBNO60934 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBNO60934 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBNO60934 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBNO60934 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBNO60934 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBNO60934 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBNO60934 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBNO60934 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBNO60934 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms