Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSCO60682 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSCO60682 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSCO60682 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSCO60682 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSCO60682 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSCO60682 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSCO60682 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSCO60682 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MSCO60682 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSCO60682 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSCO60682 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSCO60682 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSCO60682 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSCO60682 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSCO60682 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSCO60682 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MSCO60682 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSCO60682 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSCO60682 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSCO60682 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSCO60682 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSCO60682 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSCO60682 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSCO60682 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSCO60682 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSCO60682 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSCO60682 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSCO60682 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSCO60682 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSCO60682 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MSCO60682 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSCO60682 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSCO60682 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSCO60682 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSCO60682 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSCO60682 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSCO60682 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MSCO60682 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSCO60682 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSCO60682 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSCO60682 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MSCO60682 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSCO60682 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSCO60682 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSCO60682 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSCO60682 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSCO60682 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSCO60682 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSCO60682 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSCO60682 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSCO60682 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSCO60682 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSCO60682 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSCO60682 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSCO60682 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSCO60682 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSCO60682 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSCO60682 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSCO60682 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSCO60682 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSCO60682 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSCO60682 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSCO60682 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms