Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNT1O60563 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNT1O60563 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNT1O60563 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNT1O60563 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms