Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMFO60524 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMFO60524 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMFO60524 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMFO60524 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMFO60524 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMFO60524 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMFO60524 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMFO60524 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMFO60524 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMFO60524 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMFO60524 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMFO60524 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMFO60524 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMFO60524 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMFO60524 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMFO60524 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMFO60524 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMFO60524 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMFO60524 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMFO60524 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMFO60524 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMFO60524 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMFO60524 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMFO60524 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMFO60524 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMFO60524 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMFO60524 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMFO60524 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMFO60524 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMFO60524 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMFO60524 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMFO60524 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMFO60524 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMFO60524 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMFO60524 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMFO60524 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMFO60524 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMFO60524 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMFO60524 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMFO60524 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMFO60524 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMFO60524 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMFO60524 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMFO60524 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMFO60524 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMFO60524 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMFO60524 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMFO60524 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMFO60524 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMFO60524 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMFO60524 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMFO60524 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMFO60524 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMFO60524 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMFO60524 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMFO60524 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMFO60524 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMFO60524 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMFO60524 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMFO60524 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMFO60524 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMFO60524 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMFO60524 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMFO60524 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMFO60524 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMFO60524 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMFO60524 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMFO60524 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMFO60524 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMFO60524 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMFO60524 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMFO60524 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMFO60524 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMFO60524 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMFO60524 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMFO60524 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMFO60524 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMFO60524 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMFO60524 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMFO60524 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMFO60524 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMFO60524 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMFO60524 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMFO60524 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMFO60524 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMFO60524 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMFO60524 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMFO60524 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMFO60524 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMFO60524 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMFO60524 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms