Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8B3O60423 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP8B3O60423 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms