Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms