Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSNA1O43805 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms