Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR3O43731 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR3O43731 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms