Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP2AO43633 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms