Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
FOXO3O43524 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FOXO3O43524 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms