Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COCHO43405 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COCHO43405 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COCHO43405 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COCHO43405 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COCHO43405 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COCHO43405 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COCHO43405 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COCHO43405 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COCHO43405 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COCHO43405 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COCHO43405 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COCHO43405 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COCHO43405 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COCHO43405 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COCHO43405 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COCHO43405 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COCHO43405 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COCHO43405 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COCHO43405 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COCHO43405 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COCHO43405 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COCHO43405 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COCHO43405 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COCHO43405 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COCHO43405 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COCHO43405 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COCHO43405 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COCHO43405 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COCHO43405 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COCHO43405 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COCHO43405 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COCHO43405 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COCHO43405 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COCHO43405 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COCHO43405 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COCHO43405 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COCHO43405 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COCHO43405 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COCHO43405 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COCHO43405 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COCHO43405 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COCHO43405 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COCHO43405 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COCHO43405 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COCHO43405 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COCHO43405 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COCHO43405 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COCHO43405 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COCHO43405 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COCHO43405 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COCHO43405 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COCHO43405 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COCHO43405 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COCHO43405 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COCHO43405 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COCHO43405 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COCHO43405 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COCHO43405 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COCHO43405 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COCHO43405 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COCHO43405 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COCHO43405 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COCHO43405 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COCHO43405 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COCHO43405 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COCHO43405 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COCHO43405 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COCHO43405 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COCHO43405 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COCHO43405 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COCHO43405 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COCHO43405 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COCHO43405 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COCHO43405 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COCHO43405 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COCHO43405 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COCHO43405 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COCHO43405 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COCHO43405 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COCHO43405 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COCHO43405 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms