Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPAA1O43292 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms