Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms