Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF10O15013 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF10O15013 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms