Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIP1O00291 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIP1O00291 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIP1O00291 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIP1O00291 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIP1O00291 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HIP1O00291 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIP1O00291 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIP1O00291 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIP1O00291 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIP1O00291 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIP1O00291 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIP1O00291 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIP1O00291 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIP1O00291 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIP1O00291 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIP1O00291 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIP1O00291 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIP1O00291 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIP1O00291 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIP1O00291 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIP1O00291 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIP1O00291 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HIP1O00291 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIP1O00291 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HIP1O00291 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HIP1O00291 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HIP1O00291 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HIP1O00291 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HIP1O00291 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HIP1O00291 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HIP1O00291 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HIP1O00291 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIP1O00291 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIP1O00291 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIP1O00291 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIP1O00291 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIP1O00291 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIP1O00291 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIP1O00291 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIP1O00291 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIP1O00291 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIP1O00291 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIP1O00291 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIP1O00291 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIP1O00291 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HIP1O00291 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIP1O00291 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIP1O00291 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIP1O00291 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIP1O00291 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIP1O00291 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIP1O00291 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIP1O00291 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIP1O00291 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIP1O00291 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIP1O00291 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIP1O00291 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIP1O00291 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIP1O00291 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIP1O00291 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIP1O00291 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIP1O00291 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms