Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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