Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMKR1H3BMG3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMKR1H3BMG3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms