Protein–RNA interactions for Protein: F8W8V4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W8V4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8W8V4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8W8V4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8W8V4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
F8W8V4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8W8V4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8W8V4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8W8V4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8W8V4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8W8V4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8W8V4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8W8V4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8W8V4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8W8V4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8W8V4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8W8V4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8W8V4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8W8V4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8W8V4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8W8V4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8W8V4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8W8V4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F8W8V4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
F8W8V4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
F8W8V4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
F8W8V4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F8W8V4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F8W8V4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F8W8V4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
F8W8V4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F8W8V4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
F8W8V4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W8V4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W8V4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W8V4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W8V4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W8V4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.31■■□□□ 1
F8W8V4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W8V4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W8V4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.31■■□□□ 1
F8W8V4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W8V4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W8V4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W8V4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8W8V4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W8V4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8W8V4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W8V4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W8V4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W8V4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W8V4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W8V4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8W8V4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8W8V4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W8V4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
F8W8V4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F8W8V4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
F8W8V4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F8W8V4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
F8W8V4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms