Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NACAE9PAV3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms