Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L21D6R901 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L21D6R901 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms