Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HHLA1C9JL84 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HHLA1C9JL84 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms