Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF28PB7ZC32 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms