Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ERVV-1B6SEH8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVV-1B6SEH8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms