Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM5B3KS81 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM5B3KS81 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM5B3KS81 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM5B3KS81 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM5B3KS81 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM5B3KS81 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRRM5B3KS81 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM5B3KS81 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM5B3KS81 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM5B3KS81 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRRM5B3KS81 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRRM5B3KS81 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms