Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP27XA6NNY8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms