Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms