Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms