Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALM3A6NDB9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PALM3A6NDB9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms