Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EME2A4GXA9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EME2A4GXA9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EME2A4GXA9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EME2A4GXA9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EME2A4GXA9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EME2A4GXA9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EME2A4GXA9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EME2A4GXA9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EME2A4GXA9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EME2A4GXA9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EME2A4GXA9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EME2A4GXA9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EME2A4GXA9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EME2A4GXA9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EME2A4GXA9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EME2A4GXA9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EME2A4GXA9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EME2A4GXA9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EME2A4GXA9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EME2A4GXA9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EME2A4GXA9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EME2A4GXA9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EME2A4GXA9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EME2A4GXA9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EME2A4GXA9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EME2A4GXA9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EME2A4GXA9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EME2A4GXA9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EME2A4GXA9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EME2A4GXA9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EME2A4GXA9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EME2A4GXA9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EME2A4GXA9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EME2A4GXA9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EME2A4GXA9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EME2A4GXA9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EME2A4GXA9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EME2A4GXA9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EME2A4GXA9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EME2A4GXA9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EME2A4GXA9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms