Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTAGE9A4FU28 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms