Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms