Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1E9

TRBV7-7, T-cell receptor beta variable 7-7 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms