Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY99

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY99 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YY99 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms