Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms