Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
V9GY48 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
V9GY48 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
V9GY48 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
V9GY48 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
V9GY48 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
V9GY48 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
V9GY48 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
V9GY48 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
V9GY48 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
V9GY48 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
V9GY48 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
V9GY48 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
V9GY48 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
V9GY48 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
V9GY48 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
V9GY48 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
V9GY48 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
V9GY48 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
V9GY48 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
V9GY48 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
V9GY48 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
V9GY48 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
V9GY48 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
V9GY48 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
V9GY48 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
V9GY48 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
V9GY48 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
V9GY48 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
V9GY48 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
V9GY48 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
V9GY48 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
V9GY48 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
V9GY48 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
V9GY48 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
V9GY48 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
V9GY48 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
V9GY48 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
V9GY48 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
V9GY48 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
V9GY48 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
V9GY48 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
V9GY48 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
V9GY48 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
V9GY48 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
V9GY48 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
V9GY48 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
V9GY48 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
V9GY48 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
V9GY48 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
V9GY48 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
V9GY48 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
V9GY48 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
V9GY48 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
V9GY48 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
V9GY48 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
V9GY48 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
V9GY48 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
V9GY48 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
V9GY48 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
V9GY48 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
V9GY48 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
V9GY48 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
V9GY48 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
V9GY48 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
V9GY48 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
V9GY48 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
V9GY48 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
V9GY48 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
V9GY48 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
V9GY48 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
V9GY48 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
V9GY48 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
V9GY48 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
V9GY48 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
V9GY48 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
V9GY48 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
V9GY48 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
V9GY48 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms