Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJA3Q9Y6H8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms