Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms