Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A2

CYP46A1, Cholesterol 24-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP46A1Q9Y6A2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CYP46A1Q9Y6A2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP46A1Q9Y6A2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms