Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD54BQ9Y620 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms