Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFG3L2Q9Y4W6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms