Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.33
RAD54L2Q9Y4B4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RAD54L2Q9Y4B4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RAD54L2Q9Y4B4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms