Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NFE2L3Q9Y4A8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NFE2L3Q9Y4A8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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