Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATF5Q9Y2D1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ATF5Q9Y2D1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF5Q9Y2D1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF5Q9Y2D1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF5Q9Y2D1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF5Q9Y2D1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF5Q9Y2D1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF5Q9Y2D1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF5Q9Y2D1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF5Q9Y2D1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF5Q9Y2D1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF5Q9Y2D1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF5Q9Y2D1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF5Q9Y2D1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms