Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RCE1Q9Y256 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCE1Q9Y256 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms