Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML2Q9UQR0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms