Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THSD7AQ9UPZ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7AQ9UPZ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms