Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
AGAP1Q9UPQ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms